Los Órganos Internos de Control, fungen como una extensión de la Secretaría Anticorrupción y Buen Gobierno; por lo que son unidades administrativas, a cargo de promover, evaluar y fortalecer el funcionamiento del control interno de las Dependencias y Entidades Paraestatales de la Administración Pública Estatal de Baja California, que conforme a las leyes y reglamentos sean competentes para aplicar las normas en materia de control interno, auditoría, fiscalización y responsabilidades de las personas servidoras públicas; para el cumplimiento de sus atribuciones, se desempeñan bajo las directrices que establezca la persona Titular de la Secretaría y ejercen las facultades conferidas en la Constitución Política de los Estados Unidos Mexicanos y Constitución Política del Estado Libre y Soberano de Baja California.

Edificio del Poder Ejecutivo, 4to piso, Calzada Independencia No. 994, Centro Cívico, C.P. 21000, Mexicali, Baja California.
Tel: (686) 558-1135
Edificio del Poder Ejecutivo, 4to piso, Calz. Independencia y Paseo de los Héroes, Centro Cívico, Mexicali, Baja California.
Tel: (686) 555-4920, 555-4921, 555-4922
Calle Calafia, No. 473, local 5-D, Centro Cívico, C.P. 21000, Mexicali, B.C.
Tel: (686) 838-7792
Blvd. Aguacaliente, No. 21939, Fraccionamiento el Paraíso, C.P. 22106, Tijuana, Baja California.
Tel: (664) 979-2920, 979-2926
Centro de Gobierno del Estado, segundo piso en carretera Transpeninsular Ensenada-La Paz, No. 6500 Ex-Ejido Chapultepec, Ensenada, B.C.
Tel: (646) 172-3034